卫青自己率左将军公孙贺、后将军曹襄从正面进兵，直插匈奴单于驻地。此时，匈奴方面赵信向伊稚斜单于建议：“汉军不知道厉害，竟打算穿过沙漠。到时候，人困马乏，我们以逸待劳，就可以俘虏他们。”于是下令所有的粮草辎重，再次向北转移，而把精锐部队埋伏在沙漠北边。

　　卫青大军北行一千多里，跨过大沙漠，与严阵以待的匈奴军遭遇了。卫青临危不惧，敏锐的识破了对手的用心，命令部队用武刚车(铁甲兵车)迅速环绕成一个坚固的阵地，然后派出五千骑兵向敌阵发起冲击。匈奴也不敢大意，以一万骑兵来迎击，开始的时候双方都很谨慎。

　　但匈奴的冲击力习惯性的将战斗引入乱战的局面，战场呈现胶着状态，此时战局正悄然向有利于汉军的方向发展。由于卫青事先构筑了坚实的防线，匈奴的中线突击没能冲破汉军的防线，随着时间的延长，匈奴军逐渐进入了汉军的口袋，汉军的中线部队开始收缩，有意将匈奴引入口袋中。

　　战斗持续到了黄昏，突然狂风大作，飞沙走石，两军在沙漠中对面不相见，局面一度陷入混乱。卫青却能处变不惊，敏锐的感知到反攻的时机到了，下令早已待命的两翼骑兵部队突进，对敌完成合围。匈奴的军队在汉军侧翼的打击下终于崩溃，单于看到汉军人数众多，士气旺盛，知道无法取胜，慌忙骑上快马，率领精壮骑兵数百人，向西北方向突围逃去。

　　卫青发现单于逃走，立刻派出轻骑连夜追赶，匈奴人马纷纷溃散。汉军追赶了两百多里，虽然没有找到单于的踪迹，却俘虏匈奴官兵19000人。卫青率领大军一直挺进到寘(田)颜山赵信城(今蒙古人民共和国境内)。匈奴兵已经逃空，城里贮存了不少粮草。大军在那里停留了一天，卫青让兵士们饱餐了一顿，把多余的积粮烧了，然后奏凯而还。

　　在《正说两汉四百年》一书中比较全面客观的评价了卫青在这次战争中的表现：在战争中，卫青突出的个人能力和沉着坚毅的指挥，给了将士们以极大的鼓舞，恰恰激发了士兵的作战能力，从而弥补了兵力上的不足。卫青正面的拼杀为两翼的迂回包抄赢得了时间。匈奴溃败时，卫青又乘胜追击，向纵深发展，扩大战果，并焚毁其粮库，给匈奴以毁灭性的打击。这是一次堪称完美的决战。

　　另一路骠骑将军霍去病，率兵出代郡后，北进两千余里，渡过大沙漠，与左贤王的军队遭遇。在战斗中，俘获了匈奴顿头王、韩王以下7万多人，活捉匈奴的相国、将军、当户、都尉等83人，左贤王及其将领弃军逃走。

　　漠北战役是汉匈间规模最大，战场距中原最远，也是最艰苦的一次战役，汉军打垮了匈奴的两大战略集团，共歼灭匈奴9万多主力精锐。其中，卫青军歼敌19000余人。经过此战， 

　　匈奴元气大伤。此后，逐渐向西北迁徙，出现了“漠南无王廷”，匈奴对汉朝的军事威胁基本上解除了。此一战在汉朝对匈奴的战争中起到了决定性的作用。

　　直到元封五年(公元前106年)卫青去世，双方一直处于休战状态。卫青在抗击匈奴进犯的战争中，前后7次率兵出塞，为汉朝立下了不可磨灭的战功。此后，汉武帝除了奖赏两路大军的有功人员外，并加封卫青、霍去病为大司马，卫青的尊荣在当时达到了登峰造极的程度。